[Seraid]

Ein paar mehr Infos wären nicht schlecht. Um welches Spiel geht es den überhaupt? Oder kommt der Fehler bei allen ROMS?

Du kannst ja mal einen anderen Speichertyp ausprobieren.
Options -> Emulation Setups -> NDS Cartridge BackUp Media
das umstellen und das Spiel neustarten (File -> Reset Cartridge)

wenn es klappt
Options -> Save Options

um die Einstellungen zu speichern