Ein Iso ist ja auch nur das Abbild (Image) einer DVD/Bluray!
Du müßtest also erst mal aus der MKV eine DVD/Bluray authoren und dann mit einem Brennprogramm ein Iso-Image erstellen.
Kann mit aber aber nicht vorstellen, dass das Bild dadurch besser wird.
Das das Bild bei der Iso so gut ist, liegt wohl daran, das es sich meist um unveränderte Daten des Originals handelt.
Iso =
http://de.wikipedia.org/wiki/ISO-Abbild
mkv =
http://de.wikipedia.org/wiki/Matroska