Egal was in den AGB steht, den 3DS können sie nicht bricken.
Sie können dich Anzeigen (das hätten sie aber schon beim Dsi können), oder bannen (wäre ebenfalls schon beim Dsi möglich gewesen), aber der 3DS ist dein Eigentum, den können sie nicht zerstören. Denn auch Nintendo muss sich an die Gesetze halten.
EDIT (Antwort zu deinem Edit): Es ist nicht verboten Flashcards zu benutzen. Nach dem deut. Gesetz ist es erlaubt Sicherheitskopien von seinen Spielen zu machen. Somit kann Nintendo nicht einfach alle Flashcard-User "bestrafen" sondern die müssen beweisen, dass die Rom, die du mit deiner Flashcard auf dem 3DS zockst illegal erworben wurde. Und das ist der Knackpunkt