Für mich klingt es irgendwie so als ob er eine (z.b. c
formatiert, windows neu drauf macht und anschliessend Programme auf ner andren Partition/Platte ausführt. So rein logisch betrachtet könnte es dabei gut sein das diese Progs verseucht sind und den Virus einfach jedes mal beim Start wieder drüber bügeln, ergo mal alle Daten komplett entfernen und halt neu besorgen...
Wenn dich die Meldungen vom Antiviren Prog nerven hau es runter, weisst ja eh das was drauf ist, also was solls.. Alles löschen, alle Platten und sonstwas platt machen und neu (Orginal Software oder neue, geprüfte Downloads) draufmachen..
Alternativ installier dir VirtualPC mit antivirenprog und teste da an welcher Datei/Programm es hängt, also nach dem Start von welchem Prog die Infektionsmeldungen anfangen... Wenns direkt nachm installieren von Win und dem antiVirProg ist dürfte klar sein worans liegt...