Weiß nicht, ob es noch aktuell ist aber wenn Du im Rechner 3 Sata-Platten hast, kannst Du auf jede Festplatte drei Betriebssysteme machen (falls Du das möchtest). Jede Festplatte darf im MBR-Modus bis zu drei primäre Partitionen (da kommt jeweils ein Betriebssystem drauf) haben, der Rest muß 'logisch' partitioniert werden. Möglicherweise liegt der Fehler dort und das System möchte (um weitere primäre Partitionen zu ermöglichen) in den GPT-Modus wechseln, was natürlich Bootprobleme für die bisherigen BS mit sich brächte. Oft verhindert eine Recoverypartition (die unnötigerweise stets primär partitioniert sind) das Anlegen der dritten Primärpartition; dann muß man sie auf 'logisch' umstellen. Ich hab das neugierhalber schon gemacht (drei Platten mit jeweils drei BS) und es geht - alle schreiben sich ordentlich in den Bootloader (wenn man mit XP anfängt und dann mit W8 weitermacht, weil dessen Bootloader umständlich ist und zum Schluß kann man Vista/W7 installieren).
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