Versuch doch mal eine Datei von A nach B zu kopieren. Eigentlich bekomme die Kopie wieder neue Standard Rechte zu gewiesen. Wenn es klappt, einfach alles Kopieren.
Wenn dass nicht hilft, nimm eine GNU/Linux-Live-CD. Der Schreibschutz ist ein "extra" von NTFS. GNU/Linux kann nicht damit umgehen. Wenn du also die Daten mit einem GNU/Linux von A nach B kopierst, sollten alle Flags zurück gesetzt sein. Teste meine Idee wieder mit einer Datei, damit du dich nicht ärgerst, wenn es dann nicht klappt.
Keine Garantie dass es klappt, aber ich rechne stark damit
Edit: Und schau doch mal ob ein anderer Rechner genau das selbe Verhalten zeigt, es kann auch einfach sein das Windows sich gleich beim Installieren zerschossen hat, wäre bei mir nicht das erste mal