Ok. Alternative 2 getestet.
Keine Veränderung - Nach der manuellen Reparatur startet Windows wie immer. Genauso wie bei der automatischen Reparatur. Programme machen keine Probleme, read/write auf Systemplatte tadellos. Dann habe ich einen Neustart ausgeführt... Und der gleiche Fehler, wie oben beschrieben.

Es nervt einfach...
@Undertaker2011: Ich kenne die Meldung auch erst seit ein paar Tagen und ich bin Informatikstudent...
Es ist noch eine weitere Festplatte verbaut, auf der Windows 8 (CP) installiert ist. Dort treten keinerlei Probleme auf.
Übrigens: der ausführliche Test der Win7 Platte ist ohne Fehler zu Ende gegangen (Ultimate Boot CD).