Zunächst würde ich die Datenbanken backupen, wie z.B.
hier erklärt.
Danach:
1) deb
http://www.backports.org/debian stable mysql-dfsg das in deien /etc/apt/sources.list wenn dus nicht schon drinne hast
2) apt-get update und dann apt-get upgrade
Wenn du Probleme bekommst nochmal melden