Von MKV zu MP4 braucht man in der Regel (wie Otto79 schon andeutet) nicht konvertieren! Zumindest nicht das Videomaterial, weil das mittlerweile fast immer H264/MPEG-4 AVC ist. In den Dateinamen steht dann immer "x264". Ein Problem könnte der Ton sein, weil der in Standard-MKVs eigentlich immer AC3 ist und manche Geräte (speziell Apple Geräte) keinen AC3-Codec in MP4s akzeptieren. In xmediarecode kann man aber dann den Video-Codec "kopieren" und braucht NUR den Audio-Codec in AAC "konvertieren". Das geht dann viel, viel schneller als alles zu konvertieren. Kann man Bild und Ton kopieren, geht das noch fixer.
Das gilt natürlich nur für Standard-MKVs, weil MKV (wie auch MP4) KEIN Format sondern nur ein "Container" für unterschiedliche Audio- und Video-Formate (bzw. Codecs) ist...
Egal... bin vermutlich eh zu spät..