Das lässt sich nicht verallgemeinern. Je nach Anwendungsbereich muss dann entschieden werden.
Desweiteren muss man nach Kriterien wie Stromverbrauch, P/L Verhältnis, Kühlung/Lautstärke usw. entscheiden.
Deine Argumente sind analog zu dem "Was der Bauer nicht kennt, isst er nicht". Viele Spiele sind angeblich optimiert für nvidia(wobei da natürlich auch diverse Trinkgelder zu den Spieleentwicklern fließen) im Endeffekt auch nur Marketing. Und zum PhysX, wenn du Spiele wie Mafia 2 auf maximum Settings spielst, wird auch für die PhysX Berechnung nicht mehr allzu viel über bleiben.
Daher ist die Kombination ATI/AMD als Renderkarte und Nvidia als PhysX Beschleuniger sehr sinnvoll.
MfG