Könnte an den FPS liegen. Die meisten Fernseher und Monitore kommen mit 24 FPS in Verbindung mit 50/60 Hz Signal der Grafikkarte nicht klar. 24 FPS ist das gängige Format für Spielfilme und das kann man schlecht in 50 oder 60 Aktualisierungen pro Sekunde aufteilen, was hierzulande der Standart für die Bildwiederholfrequenz der Bildschirme ist. Da werden dann hin und wieder Frames fallengelassen um die Synchronität von Ton und Bild zu gewährleisten. Das findet man auch in den Einstellungen bei VLC oder im CCC von Radeon. Bei gleichmäßigen Kamerafahrten nimmt man das aber dann als Ruckeln wahr. Daher haben die meisten Grafikkarten einen 24 Hz Modus um dem Problem entgegenzuwirken.
Ansonsten kann es natürlich zum Ruckeln kommen wenn der PC im Hintergrund noch Arbeitet (z.B. ein Archiv entpackt), aber ich denke das weißt du.

Eigentlich sollte dein System bei HD keine Probleme haben. Festplatte defragmentieren und nie komplett mit Daten füllen (90% ist schon viel, ich versuche nicht über 80% zu kommen) wäre evtl noch nen Versuch wert. Treiber der Grafikkarte und DirectX natürlich auch nicht vergessen zu Aktualisieren.
Hoffe irgendwas davon konnte helfen.