Ja, geht ganz einfach mit Windows-Bordmitteln:
cmd-Fenster öffnen (Eingabeaufforderung), mit dem Befehl
convert kann jetzt ein beliebiges Laufwerk von FAT32 auf NTFS geändert werden.
Genaue Anleitung entweder in der Eingabeaufforderung mit
convert /? oder bei Microsoft:
http://support.microsoft.com/kb/314097/de
Aber Achtung! Ein Datenverlust kann nicht gänzlich ausgeschlossen werden (wie bei allen sensiblen Dateioperationen), also wenn du wirklich wichtige Daten draufhast, kommst du so oder so nicht drumherum, sie vorher zu sichern. Das Konvertieren kann nicht rückgängig gemacht werden (also von NTFS zu FAT32), wofür es aber auch keinen wirklichen Grund geben dürfte.